華大基因攜手阿里云,打造基因行業(yè)的“應(yīng)用市場”
2016-02-23 11:29:25

隨著運行在阿里云上的 BGI Online beta 版本上線,人類距離24小時完成一個人全基因組測序和分析的夢想又邁出了堅實的一步。日前,華大基因宣布其在阿里云計算平臺部署的服務(wù)產(chǎn)品BGI Online國內(nèi)beta版本正式上線,堪稱基因行業(yè)的“應(yīng)用市場”。該產(chǎn)品順利上線是繼去年10月華大基因、阿里云、英特爾在第十屆國際基因組學(xué)大會上宣布聯(lián)手啟動搭建亞太首個精準(zhǔn)醫(yī)療開發(fā)平臺后取得的首個重要成果。這也是首個完全部署在阿里云上的大規(guī)模生物信息分析平臺。

隨著生命科學(xué)領(lǐng)域數(shù)據(jù)爆炸式的增長,如何及時獲取、快速分析、安全儲存這些龐大的數(shù)據(jù)是研究者們急需解決的問題。

BGI Online就是為此而生,它集成了高性能計算,大規(guī)模存儲及安全網(wǎng)絡(luò)互聯(lián)等基礎(chǔ)設(shè)施,支持數(shù)據(jù)的云端存儲、分析、展示和交付。用戶可以在BGI Online上訪問自己的數(shù)據(jù),獲取標(biāo)準(zhǔn)分析結(jié)果,也可以定制個性化的數(shù)據(jù)分析方案,并與其他授權(quán)用戶分享數(shù)據(jù)和成果。


華大基因研究院院長、首席科學(xué)家徐訊表示:“BGI Online將會吸引第三方應(yīng)用開發(fā)者和數(shù)據(jù)分析服務(wù)廠商,將他們的應(yīng)用整合到公共平臺中,最終打造成為類似蘋果的APP Store。”

在這個“基因應(yīng)用市場”中,華大基因的測序儀類似于一部智能手機,用戶可以到BGI Online“下載”各種官方或第三方應(yīng)用,進一步開發(fā)自己的數(shù)據(jù)解讀和分析系統(tǒng)。BGI Online將在后續(xù)版本中引進第三方應(yīng)用開發(fā)者和數(shù)據(jù)分析服務(wù)商,并將于近期召開“中國生物信息與云計算產(chǎn)業(yè)聯(lián)盟籌備暨開發(fā)者大會”與開發(fā)者共享行業(yè)發(fā)展成果。

華大基因研究院副院長、信息技術(shù)中心主任方林介紹,除了基于云端的平臺,華大基因也在開發(fā)整合硬件軟件技術(shù)的BGI Appliance一體機,通過一體機與BGI Online的互動,為用戶提供更加豐富的體驗。

值得一提的是,依托阿里云的彈性存儲和計算優(yōu)勢,BGI Online不但可以滿足基礎(chǔ)科研、作物育種及臨床應(yīng)用等不同應(yīng)用場景和模式對數(shù)據(jù)處理、存儲和傳輸?shù)男枨?,還通過使用一系列先進的數(shù)據(jù)技術(shù),滿足HIPAA法案等行業(yè)安全條例的要求。同時,使用內(nèi)資服務(wù)器存儲和分析敏感的基因數(shù)據(jù),也更加符合我國《人類遺傳資源管理辦法》的規(guī)范。簡潔易用的界面和高度安全的特性,使醫(yī)生和研究者們可以把管理數(shù)據(jù)、硬件維護等繁雜的工作交給BGI Online和阿里云,從而更專注于他們要解決的科學(xué)和臨床問題。

這意味著,對于科研院所、醫(yī)療機構(gòu)及中小型基因行業(yè)創(chuàng)業(yè)公司來說,只要擁有基因數(shù)據(jù),不必自建和維護昂貴而復(fù)雜的計算、存儲平臺,通過BGI Online便可以解碼神秘基因背后的奧秘。全球最大的基因組學(xué)研發(fā)機構(gòu)華大基因打開了基因行業(yè)這扇神秘大門,讓基因行業(yè)變得“觸手可及”。

BGI Online產(chǎn)品負責(zé)人金鑫表示,阿里云在云計算、大數(shù)據(jù)領(lǐng)域有豐富的經(jīng)驗和積累,能夠滿足華大基因在數(shù)據(jù)處理、隱私安全保護以及傳輸方面極為嚴(yán)苛的要求。目前華大基因在生育健康、腫瘤防治等領(lǐng)域的眾多分析流程已經(jīng)可以在BGI Online上運行。今后華大基因?qū)y手阿里云進一步開發(fā)和完善BGI Online產(chǎn)品,為全球研究者和用戶提供更便捷、更安全的服務(wù)。BGI Online團隊也將不斷引進云計算、大數(shù)據(jù)、生物信息等方面的高水平人才,不斷打磨更高質(zhì)量的產(chǎn)品。

阿里云為華大基因提供了全線的云服務(wù)產(chǎn)品,并且針對BGI Online平臺特點在項目改造遷移中提供了強有力的技術(shù)支持和運維保障。阿里云高級專家孟方介紹,BGI Online平臺通過阿里云提供的混合云部署模式很好的解決了華大內(nèi)部客戶高速低延時的數(shù)據(jù)傳輸需求。通過阿里云節(jié)點提供的多線BGP接入,滿足了全球客戶高速訪問的需求。同時,低成本的數(shù)據(jù)存儲、彈性數(shù)據(jù)分析計算平臺都很好地解決了華大基因的業(yè)務(wù)需求。

BGI Online平臺的成功遷移證明了阿里云在生命科學(xué)領(lǐng)域的產(chǎn)品支持已經(jīng)達到世界領(lǐng)先水平。借助最先進的云計算技術(shù),BGI Online使得生物信息分析和數(shù)據(jù)管理能力變得更容易獲取,極大降低了平臺用戶和華大的基因數(shù)據(jù)分析成本,為即將到來的基因大數(shù)據(jù)時代提供了高質(zhì)量的基礎(chǔ)設(shè)施,為精準(zhǔn)醫(yī)療、分子育種等產(chǎn)業(yè)的發(fā)展打下了堅實的基礎(chǔ)。

據(jù)透露,BGI Online除了針對華大基因內(nèi)部及客戶使用外,也將于近期啟動對外的免費公測服務(wù)。

“我們的目標(biāo)是使用自主知識產(chǎn)權(quán)的測序儀和云端分析平臺,在24小時內(nèi)完成一個人從全基因組測序、分析到解讀的全過程。雖然面臨著不小的挑戰(zhàn),但生命的價值值得我們?yōu)橹Α_@樣的努力勢必會使中國在未來數(shù)十年在生命科學(xué)、生物產(chǎn)業(yè)獲得持續(xù)增長的強勁動力?!比A大基因股份有限公司CEO尹燁說。

在阿里云計算總裁胡曉明看來,2016年視覺革命、生命科學(xué)和數(shù)據(jù)創(chuàng)業(yè)三個行業(yè)將迎來爆發(fā)性增加。他認為,2016年將是生命科學(xué)產(chǎn)業(yè)發(fā)生重大變化的一年?!盎蛘诤途珳?zhǔn)醫(yī)療形成交叉,人體正在變得數(shù)據(jù)化。生命科學(xué)領(lǐng)域數(shù)據(jù)爆炸式的增長,對海量數(shù)據(jù)的計算、存儲和分析提出新的挑戰(zhàn)。阿里云將持續(xù)創(chuàng)新,為生命科學(xué)領(lǐng)域提供強大的計算能力,為生命科學(xué)領(lǐng)域的發(fā)展發(fā)揮無法計算的價值?!焙鷷悦髡f。 


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