深度學(xué)習(xí)在眼科,皮膚科,放射科和病理學(xué)等醫(yī)學(xué)學(xué)科的應(yīng)用最近顯示出巨大的前景,可以為全世界患者提高高質(zhì)量醫(yī)療保健的準(zhǔn)確性和可用性。谷歌的報(bào)告同樣說(shuō)明,卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)能夠在一定程度上準(zhǔn)確地檢測(cè)淋巴結(jié)中的乳腺癌轉(zhuǎn)移,其水平能夠媲美經(jīng)過(guò)專業(yè)訓(xùn)練的病理學(xué)家。但通過(guò)復(fù)合光學(xué)顯微鏡進(jìn)行直接的組織可視化仍然是病理學(xué)家診斷疾病的主要手段,所以影響病理學(xué)廣泛采用深度學(xué)習(xí)的關(guān)鍵障礙是:微觀組織的數(shù)字可視化。
在今天舉行的美國(guó)癌癥研究協(xié)會(huì)年度會(huì)議上,谷歌的科學(xué)家公布了一份名為“An Augmented Reality Microscope for Real-time Automated Detection of Cancer”的論文,他們描述了一個(gè)增強(qiáng)現(xiàn)實(shí)顯微鏡(Augmented Reality Microscope,ARM)平臺(tái),并認(rèn)為這可以幫助加速全世界的病理學(xué)家采用深度學(xué)習(xí)工具。這個(gè)平臺(tái)由改進(jìn)的光學(xué)顯微鏡組成,支持實(shí)時(shí)圖像分析,并且能將機(jī)器學(xué)習(xí)算法的結(jié)果直接渲染在視場(chǎng)之中。重要的是,谷歌的ARM平臺(tái)可以通過(guò)低成本,易于使用的組件來(lái)集成到各個(gè)醫(yī)院和診所中現(xiàn)有的光學(xué)顯微鏡,同時(shí)不需要分析整個(gè)組織的數(shù)字化版本。
現(xiàn)代計(jì)算組件和深度學(xué)習(xí)模型將支持大范圍的預(yù)訓(xùn)練模型運(yùn)行在這一平臺(tái)。在傳統(tǒng)的模擬顯微鏡中,用戶主要是通過(guò)目鏡觀察樣品。機(jī)器學(xué)習(xí)算法能夠?qū)⑤敵鰧?shí)時(shí)投影回光路,數(shù)字投影將疊加在樣本的原始(模擬)圖像上,從而幫助用戶定位或量化目標(biāo)特征。重要的是,計(jì)算和視覺(jué)反饋能夠迅速更新,速度約為每秒10幀,所以模型輸出能夠?qū)崿F(xiàn)無(wú)縫更新。
左圖:ARM的示意圖。數(shù)碼相機(jī)能夠捕捉與用戶相同的視場(chǎng),并將圖像傳送到能夠運(yùn)行機(jī)器學(xué)習(xí)模型實(shí)時(shí)參考的附加計(jì)算單元。結(jié)果將反饋到一個(gè)自定義的,與目鏡一致的AR顯示屏中,并將模型輸出投影到與顯微鏡玻璃片相同的平面上。右圖:谷歌原型已改裝成典型的臨床級(jí)光學(xué)顯微鏡。
原則上,ARM可以提供各種視覺(jué)反饋,包括文本,箭頭,輪廓,熱圖或動(dòng)畫,并且能夠運(yùn)行多種類型的機(jī)器學(xué)習(xí)算法以解決不同的問(wèn)題,如對(duì)象檢測(cè),量化或分類。
為了展示ARM的潛在用途,谷歌將其配置為運(yùn)行兩種不同的癌癥檢測(cè)算法:一種檢測(cè)淋巴結(jié)標(biāo)本中的乳腺癌轉(zhuǎn)移;另一種檢測(cè)前列腺切除標(biāo)本中的前列腺癌。模型可以在4-40倍的放大倍數(shù)下運(yùn)行,并且通過(guò)綠色輪廓來(lái)突出檢測(cè)到的腫瘤區(qū)域,從來(lái)顯示給定模型的結(jié)果。綠色輪廓有助于將病理學(xué)家的注意力吸引到相關(guān)區(qū)域,同時(shí)不會(huì)掩蓋潛在的腫瘤細(xì)胞外觀。
上圖:通過(guò)ARM透鏡觀察到的示例視圖,其顯示了4倍,10倍,20倍和40倍顯微鏡物鏡下的淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移模型。
在最初的訓(xùn)練中,兩種癌癥模型采用了搭載明顯不同光學(xué)配置的全視野數(shù)字切片掃描儀圖像,但即便沒(méi)有額外的重新培訓(xùn),模型在ARM上的表現(xiàn)都十分優(yōu)秀。例如,淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移模型的曲線下面積(AUC)為0.98,而在ARM上運(yùn)行時(shí),谷歌前列腺癌模型在視場(chǎng)中的癌癥檢測(cè)AUC為0.96,性能略低于WSI(全視野數(shù)字化切片)。谷歌表示,通過(guò)利用直接從ARM獲取的數(shù)字圖像進(jìn)行額外訓(xùn)練,他們可以進(jìn)一步提高模型的性能。
谷歌表示,他們相信ARM有潛力對(duì)全球健康帶來(lái)重大的積極作用,特別是對(duì)發(fā)展中國(guó)家中傳染病的診斷,如肺結(jié)核和瘧疾。另外,對(duì)于正在采用數(shù)字病理工作流程,但其掃描儀仍然面臨重大挑戰(zhàn)或需要快速結(jié)果的醫(yī)院而言,ARM同樣能夠發(fā)揮重要的作用。當(dāng)然,光學(xué)顯微鏡在病理學(xué)以外的很多行業(yè)都已經(jīng)證明了自己的作用,而ARM可以廣泛適用于醫(yī)療保健,生命科學(xué)研究和材料科學(xué)等應(yīng)用。谷歌進(jìn)一步指出,他們對(duì)進(jìn)一步探索ARM如何能加速機(jī)器學(xué)習(xí)的普及來(lái)積極地影響世界感到十分興奮。
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